A Integra é composta pelas entidades filantrópicas e conduzida por uma Diretoria, um Conselho Fiscal e uma Comissão de Ética das organizações. Este modelo de governança foi constituído na assembleia de fundação e aprovados por regime de votação. Os representantes são indicados pelas entidades associadas.
Diretoria:
- Diretor Presidente - Dettloff von Simson Junior, presidente do CPTI e Diretor Financeiro do PROGEN;
- Vice-Presidente de Comunicações e Relações Institucionais - Lúcia Decot Sdoia, presidente do Instituto Padre Haroldo;
- Vice-Presidente Jurídico - Raquel de Castro Duarte Martins, presidente do SPES - Serviço Social da Par. São Paulo Apóstolo;
- Vice-Presidente de Projetos - Joaquim Paulino de Oliveira Neto, diretor da Creche Menino Jesus de Praga;
- Vice-Presidente Financeiro - Roberto Batista da Silva, presidente do Centro Comunitário do Jardim Santa Lúcia.
Suplentes de diretoria:
- Marco Antonio Gonçalves Caporali, presidente da Casa da Criança de Sousas;
- Jimena Franco Carmello, vice-presidente da Fundação Eufraten;
- Ana Lúcia da Silva Batista, gerente operacional da Obra Social São João Bosco.
